سامانه اتاق پایاپای الکترونیکی بانکها (پایا) سامانه اتاق پایاپای الکترونیکی به عنوان یکی دیگر از پروژه های سیستم نظام جامع پرداخت می باشد . این سامانه کمک شایان توجهی به گسترش بانکداری الکترونیکی در کشور خواهد نمود. این سامانه برای پرداختهای با مبالغ خرد اما تعداد زیاد و به صورت بین بانکی (پرداخت از یک بانک به بانک و یا بانکهای دیگر) طراحی شده و موارد زیر از جمله عناوین مورد استفاده آن خواهد بود:
پرداخت حقوق کارکنان یک سازمان
پرداخت سود سهام
پرداخت اقساط تسهیلات دریافتی
حواله های بین بانکی انفرادی